Прокачанный Аллигатор (англ. Buff Alligator) - враг, впервые появляющийся в Канализации. Является элитной версией обычного Аллигатора. Помимо увеличенных характеристик, Прокачанный Аллигатор обладает Flak Cannon, выстреливающей одним маленьким красным шаром, который при преодолении короткого расстояния или попадания в стену распадается на 10 красных снарядов. Столкнувшись с шаром, персонаж получает 14 урона, что часто является фатальным.
Прокачанный Аллигатор является более агрессивным врагом, нежели его обычная версия. Он не будет прятаться за укрытиями, а будет активно преследовать персонажа во время стрельбы.
Хотя в основном встречаются в Канализации, Прокачанных Аллигаторов можно иногда найти в Кристальных Пещерах, уничтожив кокон.